Diversité génétique – CHIEN
LABOGEN CONTRÔLE DE LA DIVERSITÉ
Dans l’élevage responsable de chiens, éviter la consanguinité joue un rôle important. La diversité génétique reflète le niveau de consanguinité d’une population ou d’une race. Si la consanguinité est évitée au fil des générations, cela se traduit par un niveau élevé de diversité génétique. Cependant, dans l’élevage de chiens de race en particulier, le risque de consanguinité est accru, par exemple en raison des livres généalogiques fermés et de l’accouplement excessif de « sires populaires« . Cela s’accompagne d’une perte de diversité génétique et d‘une dépression de consanguinité, c’est-à-dire de la propagation de variantes génétiques nocives et pathogènes.
Les effets sur la santé, tels qu’une diminution de la compétence immunitaire ou de faibles résultats de reproduction, peuvent également être des signes de dépression de consanguinité.
Le LABOGEN Diversity Check vous indique la parenté génétique des animaux de votre race et vous permet d’identifier les animaux génétiquement peu apparentés. Dans les races à très faible diversité génétique, la consanguinité peut également exister entre des animaux non apparentés en raison de l’uniformité génétique au sein de la race. Le LABOGEN Diversity Check permet de trouver des partenaires d’élevage appropriés et d’éviter la consanguinité.
De plus, nous vous indiquons la répartition toujours la plus actuelle de l’hétérozygotie dans la population de la race ou du club. C’est une autre caractéristique qui peut aider à maintenir une population en bonne santé.
La valeur d’hétérozygotie indique la variabilité génétique de l’animal individuel. Chaque individu hérite de la moitié des gènes de sa mère et de son père, et moins les parents sont génétiquement liés, plus l’hétérozygotie de la descendance peut être élevée.
Avec le LABOGEN Diversity Check, nous vous aidons à long terme à préserver et à augmenter la diversité génétique et à promouvoir durablement la santé des générations futures. Commandez simplement le profil ADN SNP Premium chez LABOKLIN et obtenez un accès gratuit au LABOGEN Diversity Check pour votre chien.
FAQ
La diversité génétique reflète le degré de consanguinité d'une race. Plus la diversité génétique est faible, plus les animaux d'une même race sont génétiquement proches les uns des autres. Le risque de consanguinité et de faible diversité génétique est accru par les livres généalogiques fermés et les petites populations d'élevage. Cela s'accompagne d'effets négatifs tels que la dépression de consanguinité et la propagation de variantes génétiques nocives et pathogènes. En préservant et en augmentant la diversité génétique, nous garantissons la santé à long terme des générations futures.
Nous calculons la diversité génétique à l'aide de polymorphismes mononucléotidiques (SNP). Nous utilisons les 230 SNP de l'empreinte génétique de votre chien (profil ADN SNP Premium) ainsi que des centaines d'autres SNP pour calculer à quel point les animaux d'une même race ou d'un même club sont génétiquement similaires. La distance génétique entre les animaux est représentée graphiquement à l'aide d'une PCoA (Principal Coordinate Analysis).
Dans le graphique de la diversité génétique, vous pouvez voir la parenté génétique de votre propre animal (carré rouge) avec d'autres animaux (points) de sa race ou de son club. Chaque point correspond à un chien. Plus les chiens sont proches les uns des autres dans le graphique, plus ils se ressemblent génétiquement. Plus le nombre d'animaux débloqués pour l'affichage dans le graphique est élevé, plus le graphique est complet, utile et pertinent. Si les propriétaires des animaux sont d'accord, vous pouvez voir le nom, la race, le sexe et la date de naissance en sélectionnant des points individuels et trouver ainsi des partenaires d'élevage potentiellement intéressants. Si vous avez déjà des candidats à l'élevage, le LABOGEN Diversity Check peut vous montrer à quel point ils sont génétiquement proches de votre propre animal. Vous pouvez nous contacter par e-mail et ainsi manifester votre intérêt. Vous trouverez peut-être des frères et sœurs de la même portée ou d'autres parents proches de votre animal et vous vous donnerez rendez-vous pour une promenade ?!
L'hétérozygotie décrit le pourcentage de caractéristiques génétiques (SNP) pour lesquelles votre chien a hérité de variantes différentes de sa mère et de son père. Si l'on compare les races, les animaux présentant une hétérozygotie élevée sont, selon les connaissances scientifiques actuelles, moins touchés par la consanguinité que les animaux présentant une hétérozygotie faible. Pour calculer l'hétérozygotie, nous utilisons l'empreinte génétique (le profil ADN SNP Premium) ainsi que des centaines d'autres caractéristiques génétiques présentes dans l'ADN de votre chien. Votre chien est marqué d'une croix et d'une ligne noire continue sur le graphique. Une fois qu'une population de référence suffisamment importante de votre race a été analysée par LABOKLIN, vous verrez la variabilité génétique de l'ensemble de la population de la race sous la forme d'une zone orange hachurée. La valeur moyenne de la race est indiquée par une ligne grise en pointillés. Les petites tailles de population et la consanguinité peuvent réduire l'hétérozygotie d'une race. Les animaux présentant une hétérozygotie élevée par rapport à la race peuvent donc contribuer à la préservation de la diversité génétique d'une race dans le cadre de l'élevage. Notez toutefois que l'hétérozygotie ne permet pas de tirer des conclusions sur des facteurs individuels tels que les maladies héréditaires ou les caractéristiques extérieures comme la couleur du pelage. La préservation de la variabilité génétique peut être un élément constitutif d'un élevage canin responsable, mais ne doit pas être considérée isolément.
Nous utilisons plusieurs centaines de polymorphismes mononucléotidiques (SNP), dont les 230 SNP de l'empreinte génétique de votre chien (profil ADN SNP Premium). Pour chaque SNP, on vérifie s'il est homozygote ou hétérozygote. Un SNP est dit homozygote si votre chien a hérité du même nucléotide (élément constitutif de l'ADN) de sa mère et de son père pour ce SNP. Un SNP est hétérozygote si votre chien a hérité de caractéristiques différentes de sa mère et de son père pour ce SNP. Nous calculons le pourcentage de tous les SNP pour lesquels votre chien est hétérozygote. Cette valeur est l'hétérozygotie.
Vous pouvez comparer les valeurs d'hétérozygotie de plusieurs chiens de votre race. Tous les chiens ont besoin pour cela du profil ADN SNP Premium de LABOKLIN. Si l'on compare les animaux d'une même race, les animaux présentant une hétérozygotie élevée sont, selon les connaissances scientifiques actuelles, moins touchés par la consanguinité que les animaux présentant une hétérozygotie faible. Dans l'élevage, l'hétérozygotie ne doit toutefois pas être surestimée. Les décisions d'élevage devraient être prises principalement sur la base des maladies héréditaires qui posent problème dans la race. Ensuite, il peut être avantageux d'inclure la préservation de la diversité génétique dans la décision d'élevage.
Les chiffres sous le graphique indiquent la fourchette dans laquelle peut se situer l'hétérozygotie de votre animal. Les pourcentages indiqués vont de 0% à 60%. En théorie, des valeurs allant jusqu'à 100% pourraient être envisagées. Les valeurs supérieures à 60% sont toutefois si peu probables que nous pouvons laisser le graphique s'arrêter à cette valeur. Si votre animal présente effectivement plus de 60% d'hétérozygotie, vous pouvez le lire sous forme de chiffre dans la case en haut à droite.
Vous recevrez un code de déverrouillage lorsque vous commanderez un profil ADN SNP Premium (ISAG 2020). Il sert à afficher en ligne le LABOGEN Diversity Check sur diversity.labogen.com. Veuillez d'abord vous connecter ici avec vos données de la boutique en ligne LABOGEN(shop.labogen.com). Si vous n'avez pas encore créé de compte chez nous, vous trouverez notre inscription sur shop.labogen.com/account. Après vous être connecté, vous pouvez créer votre résultat en saisissant le code de déverrouillage dans le LABOGEN Diversity Check.
LABOKLIN propose d'analyser séparément les animaux des clubs d'élevage. Ainsi, les animaux de son propre club peuvent être affichés indépendamment des autres envois de la même race. Les clubs intéressés par la mise en place d'un tel service peuvent nous contacterà tout moment(labogen.com/contacts).
LABOKLIN propose de gérer et d'analyser les animaux d'un club d'élevage dans sa propre base de données. Un compte officiel du club d'élevage dans le Diversity Check contient automatiquement tous les animaux du club et permet d'évaluer l'hétérozygotie et la diversité génétique des animaux du club sur le long terme. Les clubs intéressés peuvent toujours nous contacter pour mettre en place un tel service.
Lorsque vous commandez un profil ADN SNP Premium pour votre chien chez LABOKLIN, nous calculons gratuitement l'hétérozygotie de votre animal et votre animal est inclus dans le calcul de la diversité génétique. Vous pouvez consulter les résultats dans le LABOGEN Diversity Check.
Nous recommandons vivement l'envoi d'un échantillon de sang EDTA pour le profil ADN SNP Premium. Une alternative est le frottis spécial (eNAT). En raison de la quantité d'ADN plus faible dans les frottis de joues, le test est plus difficile à réaliser, ce qui peut parfois entrainer un taux d'échec plus élevé.
La durée normale du test est de 14 à 21 jours ouvrables.
